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Label-Free

时间:2018-10-30浏览次数:4977

非标定量(Label-free)

非标定量(Label-free):是一种非标志的差异卵白质组学技术,不需要使用同位素标志物标志肽段,直接凭据质谱峰的信号强度来对肽段或卵白进行相对定量。Label-free通过HPLC分级液质联用对酶解肽段进行分析,现在基于质谱的非标定量技术主要有两种:一是凭据一级质谱相关的肽段峰强度以及峰面积等信息进行卵白定量,二是凭据卵白对应肽段的二级质谱总数(spectral counts)进行定量。

 

实验步骤

1. 卵白前期处理,包罗去除核酸,卵白纯化定量,SDS聚丙烯酰氨凝胶电泳;

2. 卵白质胶内酶切;

3. 多肽纯化;

4. 多肽混淆物的质谱分析,包罗质谱判定和定量信息比力;

5. 生信分析

 

结果展示

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实验周期及交付尺度

1. 实验周期:4-6周

2. 交付尺度:卵白定量结果、判定结果、质谱原始数据、生信分析结果(GO分析、KEGG分析等等)

 

需确认的信息

1. 样本的种属

2. 样本的类型(组织or细胞or血液)

3. 样本的数量及分组

4. 分析要求

  

参考文献

[1] Hu S , Qiu N , Liu Y , et al. Identification and comparative proteomic study of quail and duck egg white protein using 2-dimensional gel electrophoresis and matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight tandem mass spectrometry analysis[J]. Poultry Science, 2016:pew033.

[2] Bouvet M , Turkieh A , Acosta-Martin A E , et al. Proteomic Profiling of Macrophages by 2D Electrophoresis[J]. Journal of Visualized Experiments, 2014(93).


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